Control de Sustancias coordina el desarrollo de jornadas anuales de capacitación, dirigidas a personal de las instituciones vinculadas al tema de control y fiscalización de sustancias, a fin de fortalecer las capacidades institucionales y brindarles herramientas y conocimientos en la detección y fiscalización de drogas. Estas instituciones son: La Policía Nacional Civil, a través de su División Anti Narcóticos (DAN), la Subdivisión de la Policía Técnica Científica Forense, la Dirección General de Aduanas (DGA) y la Dirección Nacional de Medicamentos (DNM).